工厂自动离职办理手续可能存在以下法律风险点：
1. 工资及经济补偿损失风险：若未办理离职手续，工厂可能以“未完成交接”为由扣发工资、奖金或经济补偿。例如，员工自动离职后未交接客户资料，工厂以“造成业务损失”为由拒绝发放当月工资。
2. 社保转移受阻风险：未办理离职手续，工厂可能不配合转移社会保险关系，导致员工新工作的社保无法正常缴纳。例如，员工到新公司入职后，因原工厂未停保，新公司无法为其缴纳社保，影响医疗、养老等权益。
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工厂自动离职办理手续可能存在以下特殊情况或例外情形：
1. 工厂无故拖延或拒绝办理离职手续：若工厂收到员工的书面离职申请后，无正当理由拖延超过15日未办理，可能违反《劳动合同法》第五十条“用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续”的规定，员工可向劳动监察部门投诉。
2. 员工因紧急情况无法亲自办理：如员工突发疾病或家中有重大变故，无法亲自到工厂办理手续，可委托他人代办（需提供授权委托书），或通过邮件、微信等书面形式申请，工厂应予以配合，否则可能构成违法。
3. 工厂规章制度未明确离职流程：若工厂未在员工手册或劳动合同中明确离职流程，员工可依据《劳动合同法》第三十七条的规定，提前30日书面通知工厂，工厂不得以此为由拒绝办理手续。
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针对工厂自动离职办理手续的直接回复，可依据《中华人民共和国劳动合同法》相关条款提供法律依据。
《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条规定：“劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。”
分析：自动离职属于劳动者主动解除劳动合同的情形，需提前通知用人单位。办理手续时，人力资源部门是法定的对接主体，因为其负责劳动合同的管理、工作交接的监督及离职手续的审批。若工厂拒绝办理，劳动者可依据该条款证明自己已履行通知义务，要求工厂配合办理离职手续，包括出具解除劳动合同证明、转移社会保险关系等。
结论：工厂自动离职应向人力资源部门办理手续，符合法律规定的通知义务是办理的前提。
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关于工厂自动离职去哪里办手续的问题，最直接的答案是向工厂的人力资源部门办理。
1. 若工厂有明确的离职流程规定：需严格按照流程提交书面离职申请、完成工作交接（如交接工具、文件、客户资料等），并由部门负责人及人力资源部门签字确认。
2. 若工厂未明确规定离职流程：可主动联系人力资源部门，询问所需材料（如身份证复印件、劳动合同等），并书面提交离职申请，要求对方出具离职手续办理回执。
3. 若因紧急情况无法亲自办理：可委托他人代办（需提供授权委托书及本人身份证复印件），或通过邮件、微信等书面形式向人力资源部门申请，保留沟通记录。

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